หลักสูตรปริญญาโท ที่เปิดสอนในคณะแพทยศาสตร์ มี 9 สาขาวิชาได้แก่
| 1. กายวิภาคศาสตร์ (Anatomy) | 2. จุลชีววิทยา (Microbiology) |
| 3. ชีวเคมี (Biochemistry) | 4. ปรสิตวิทยา (Parasitology) |
| 5. พิษวิทยา (Toxicology) | 6. เภสัชวิทยา (Pharmacology) |
| 7. ฟิสิกส์การแพทย์ (Medical Physic) | 8. สรีรวิทยา (Physiology) |
| 9. วิทยาศาสตร์การแพทย์คลินิก (Clinical Medical Science) | |
โครงสร้างทั่วไปของหลักสูตรปริญญาโท
หลักสูตรระดับปริญญาโท มีจำนวนหน่วยกิตรวมตลอดหลักสูตรไม่น้อยกว่า 36 หน่วยกิต
โดยแบ่งการศึกษาเป็น 2 แผน คือ
แผน ก : เป็นแผนการศึกษาที่เน้นการวิจัย โดยมีการทำวิทยานิพนธ์ การศึกษาตามแผน ก มี 2 แบบ คือ
1.1 แบบ ก 1 ทำเฉพาะวิทยานิพนธ์ไม่น้อยกว่า 36 หน่วยกิต โดยหลักสูตรอาจกำหนดให้ศึกษากระบวนวิชาเพิ่มเติม โดยไม่นับหน่วยกิตสะสม และต้องทำกิจกรรมทางวิชาการ
1.2 แบบ ก 2 ทำวิทยานิพนธ์ซึ่งมีค่าเทียบได้ไม่น้อยกว่า 12 หน่วยกิต และต้องศึกษากระบวนวิชาในระดับบัณฑิตศึกษาอีกไม่น้อยกว่า 18 หน่วยกิต
แผน ข : เป็นแผนการศึกษาที่เป็นการศึกษากระบวนวิชาในระดับบัณฑิตศึกษาไม่น้อยกว่า 24 หน่วยกิต และต้องมีการศึกษาค้นคว้าแบบอิสระไม่น้อยกว่า 3 หน่วยกิต แต่ไม่เกิน 6 หน่วยกิต
ชื่อหลักสูตร
ภาษาไทย : หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชา ……………
ภาษาอังกฤษ : Master of Science Program in ……………
ชื่อปริญญา
ภาษาไทย : ชื่อเต็ม วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต (…………) ชื่อย่อ วท.ม. (…………)
ภาษาอังกฤษ : ชื่อเต็ม Master of Science (…………) ชื่อย่อ M.S. (…………)